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Documentación de NAHPU

NAHPU Día 1

NAHPU es una aplicación de catalogación basada en proyectos. Los datos se gestionan y organizan en función de un proyecto. Cada proyecto puede tener múltiples personas, sitios, narrativas, eventos de recolección y registros de especímenes. La aplicación está diseñada para registrar especímenes de historia natural tanto en el laboratorio como en el campo, y está optimizada para pantallas de dispositivos móviles y computadoras. Si su equipo trabaja con múltiples taxones compatibles, como aves y mamíferos, puede tener ambos en el mismo proyecto.

Empezando

Sección titulada «Empezando»

  1. Crear un nuevo proyecto

    Use el botón + en la esquina inferior derecha de la pantalla de inicio. El nombre del proyecto debe tener entre 3 y 25 caracteres de largo.

    Puede agregar una descripción del proyecto. Esto es opcional, pero es útil para recordar el propósito y el alcance del proyecto.

    Luego, seleccione el formato de catálogo principal. La aplicación actualmente es compatible con formatos de catálogo de mamíferos y aves. El soporte para herpetofauna, peces y fósiles se encuentra actualmente en desarrollo.

    La aplicación lo llevará al panel de control (dashboard).

    Después de crear un proyecto, la aplicación genera automáticamente un UUID de proyecto. Este identificador único se utiliza en toda la base de datos para distinguir registros de diferentes proyectos. Usamos UUID versión 4. Es casi imposible que dos UUID choquen.

  2. Conociendo el panel de control (dashboard)

    El panel de control es la interfaz principal del proyecto. Se divide en cuatro paneles principales.

    • El panel superior izquierdo es la información del proyecto. Incluye un código QR que otros usuarios pueden escanear al crear un nuevo proyecto.
    • El panel superior derecho son los datos del personal. Este panel le permite agregar y administrar la información del personal para el proyecto. El personal se mostrará como una lista en este panel una vez creado.
    • El panel inferior izquierdo es el registro numérico de taxones. Este panel le permite agregar y administrar información de taxones para el proyecto.
    • El panel inferior derecho son las estadísticas de los registros. Este panel muestra el número de registros agregados al proyecto. Puede ingresar a la ventana de pantalla completa para ver más estadísticas.

  3. Agregar nuevo personal

    Necesita que al menos una persona asuma el papel de catalogador para el cuidado de los especímenes. Puede agregar más personas con diferentes roles.

    • El Catalogador (Cataloger) es responsable de catalogar el espécimen. En algunas instituciones, esto podría llamarse colector. En la aplicación, llamamos colector a cualquier persona que recolecte el espécimen, ya sea que participen en la catalogación en la aplicación o no. Su inicial y número de campo se usarán para generar el ID de Campo (Field ID) en la página del catálogo de especímenes. Su nombre también aparecerá cuando el formulario solicite el nombre de una persona, como el personal de recolección y el preparador. La aplicación no permite cambiar el rol del catalogador después de que se ha creado.

    • El Solo preparador (Preparator only) es una persona que ayuda a preparar el espécimen pero no participa en la gestión de los datos. Sus nombres no aparecerán en el campo del catalogador de la página de especímenes, sino en algún otro lugar, como en los campos Preparador (Preparator) y Personal de recolección (Collecting personnel) en la página del espécimen.

    • El rol de Ninguno (None) está reservado para otro personal que no participa directamente en el cuidado de los especímenes. Uno de los objetivos de NAHPU es garantizar que todos los involucrados en el campo queden registrados en los datos de campo. Puede asignar esta función a su conductor, guías locales, cocineros, etc. Sus nombres solo aparecerán en el campo Personal de recolección (Collecting personnel). Si están involucrados en la obtención de un espécimen, puede asociarlos con él.

  4. Agregar un nuevo taxón

    Puede agregar un taxón de forma manual mediante el botón agregar taxón o importar desde un archivo. Los formatos preferidos son .xlsx, .csv y .tsv. NAHPU hará su mejor esfuerzo para intentar analizar y cargar otros tipos de archivos.

    • Para los archivos delimitados reconocidos, la aplicación selecciona delimitadores por extensión (.csv = coma, .tsv = tabulación).
    • Para extensiones no reconocidas, la función de detección automática intenta utilizar Excel, comas, tabulaciones y punto y coma primero. Si eso falla, use la anulación avanzada del analizador (advanced parser override) e ingrese un delimitador personalizado.
    • El mejor soporte es para .xlsx; los formatos viejos/otros formatos de Excel podrían fallar.

    Su archivo a importar requiere todas estas columnas: class (clase), order (orden), family (familia), genus (género), epithet (epíteto). Usted también puede incluir scientific name (nombre científico), common name (nombre común) y notes (notas). La aplicación detectará automáticamente los alias de los encabezados soportados (por ejemplo, taxonClass, taxonOrder, taxonFamily, specificEpithet). Puede seleccionar manualmente el tipo de columna desde el menú desplegable si la aplicación no asigna de forma automática la columna correcta para cada dato. Las demás columnas serán ignoradas.

    Ejemplo de tabla para importar taxones:

    | class    | order    | family  | genus   | epithet   | scientific name   | common name        | notes |
    | -------- | -------- | ------- | ------- | --------- | ----------------- | ------------------ | ----- |
    | Mammalia | Rodentia | Muridae | Bunomys | coelestis | Bunomys coelestis | Heavenly hill rat  |       |
    | Mammalia | Rodentia | Muridae | Bunomys | penitus   | Bunomys penitus   | Inland hill rat    |       |

  5. Crear un sitio

    En algunos catálogos en papel, este término se etiquetará como Localidad (Locality). Navegue a la página del sitio utilizando la barra de navegación inferior. Para crear un nuevo sitio, use el botón + en la esquina superior derecha del sitio. Rellene al menos la parte del ID de sitio (Site ID). La aplicación limita el ID del sitio a 20 caracteres y exige el formato de mayúsculas. Deberá referirse a este ID en todo el campo de registro siempre que se solicite un sitio.

  6. Añadir una narrativa

    Este es su diario de campo. Puede usarlo para registrar observaciones, reflexiones y otra información relacionada con su trabajo de campo. En el campo, es una buena práctica escribir notas narrativas todos los días. Navegue a la página narrativa mediante la barra de navegación inferior. Para crear una narrativa, use el botón + en la esquina superior derecha de la narrativa. Seleccione la fecha y el ID del sitio. Seguidamente, escriba su narrativa.

  7. Agregar eventos de recolección

    Un evento de recolección, captura y rastrea los detalles de un solo esfuerzo de recolección, incluidos los datos sobre el personal, el clima y la información astronómica para un sitio y período de tiempo en específico. Los registros de especímenes van enlazados a un evento de recolección en lugar de a un sitio. Si viene de catálogos en papel, esto podría ser un nuevo concepto: piense en un evento de recolección como la "sesión" durante la cual se recolectaron los especímenes, separada del sitio donde ocurrió.

    Para crear un evento de recolección, use el botón + en la esquina superior derecha del evento de recolección. Seleccione ID de sitio, fecha de inicio, hora de inicio, fecha de finalización y hora de finalización. Luego, complete el resto del formulario.

    La aplicación combina la identificación del sitio y la fecha de inicio para crear una identificación única para cada evento de recolección. Por ejemplo, GP-L1-March, 23 2023. Usted utilizará este ID para referirse al evento de recolección en el registro del espécimen. En el raro caso de que ejecute múltiples eventos de recolección en el mismo sitio el mismo día, agregue un sufijo para distinguirlos, por ejemplo, Line1-Mar 26, 2023-1, Line1-Mar 26, 2023-2, o Line1-Mar 26, 2023-day y Line1-Mar 26, 2023-night.

  8. Agregar registros de especímenes

    Para crear un registro de espécimen, utilice el botón + en la esquina superior derecha del registro de espécimen. El ícono de registro de espécimen en la barra de navegación le informa sobre el formato activo en ese momento. Al oprimir generará el formato coincidente para el catálogo actualmente activo. La única diferencia entre los diferentes formatos de catálogo son los campos de medición. Después de crear un nuevo registro de espécimen, complete la información relevante. Repita el proceso para los siguientes especímenes.

  9. Exportar registros

    Para exportar registros, vaya al menú del panel (indicado por el icono de hamburguesa/tres líneas horizontales en la esquina superior izquierda). Disponemos de múltiples opciones de exportación:

    • Crear un reporte (Create a report). Genera una lista de especies, información multimedia y coordenadas del sitio en un formato delimitado (.csv o .tsv).

    • Empaquetar proyectos (Bundle projects). Genera reportes disponibles, como el recuento de especies, narrativas, sitios, eventos de recolección y registros de especímenes. Todos están en un formato delimitado por comas (.csv). La aplicación generará un archivo .zip que contiene todos los archivos e información multimedia.

    • Exportar registros (Export records). Puede elegir qué registros exportar. Admite exportación en formato delimitado (.csv o .tsv).

  10. Crear copia de seguridad de la base de datos (Database Backup)

    Para hacer una copia de seguridad de la base de datos, vaya al menú en el panel de control y seleccione hacer una copia de seguridad de la base de datos (backup database). Por defecto, la base de datos será exportada como un archivo sqlite3. Use el botón de alternancia incluir datos del proyecto (include project data) para agregar los datos del proyecto a la copia de seguridad. La aplicación generará un archivo .zip que contiene la base de datos y la multimedia.